Misi Jurnal Kebijakan Kesehatan Indonesia adalah menyebarluaskan dan mendiskusikan berbagai tulisan ilmiah mengenai kebijakan kesehatan. Dengan demikian jurnal ini ditujukan sebagai media komunikasi bagi kalangan yang mempunyai perhatian terhadap kebijakan kesehatan antara lain para pengambil kebijakan di tingkat pemerintah pusat, pemerintah daerah, termasuk di organisasi-organisasi pelayanan kesehatan seperti rumah sakit, dinas kesehatan, BKKBN, mau pun pengelola industri obat, alat kesehatan dan asuransi kesehatan, serta institusi pendidikan penelitian. Isi jurnal berupa artikel hasil penelitian yang berkaitan dengan kebijakan kesehatan dan berbagai tantangan yang relevan dengan perumusan, implementasi, monitoring dan evaluasi kebijakan kesehatan.